La devastada Neo-Tokio es ahora un campo de batalla dividido en dos facciones, la zona controlada por los seguidores de Akira y Tetsuo y el área controlada por Miyako, la misteriosa líder de la secta. Pero ellos no son los únicos jugadores en este tablero, ya que hay que contar con Kei y la señora, el coronel y ahora, además, con espías de otras potencias internacionales que intentan desentrañar el misterio que es Akira…